サイトのブックマークをアプリのように画面にならべる機能がiPhone、Androidにはあります。
そのアイコン指定をするのが「link rel=”apple-touch-icon”」指定なのですが、この重複でハマったのでご紹介。

こちら、このネタとまったく同じ状況でまたもやSSIでやられました。

ただ、「link rel=”apple-touch-icon”」指定は、「前勝ち」なようで
指定が前のものが優先されるようです。。。
※ブラウザ、OSバージョンによっても異なる可能性はあります。

もし「指定しているのに、設定されない！」と言った現象があったら
こういった場合も考慮してみると良いかもです。

また、サイトにBASIC認証かかってるとアイコン指定がされないようです。

現場からは以上です。